В феврале 1992 основан Российский футбольный союз (РФС, президент – В.И.Колосков), ставший правопреемником Федераций футбола СССР и СНГ. В состав РФС входит и Профессиональная футбольная лига (ПФЛ), которую возглавляет Н.А.Толстых.
Весной 1992 стартовал первый чемпионат России, который выиграл московский «Спартак». Первыми обладателями Кубка России стали столичные «торпедовцы», в финале победившие ЦСКА в серии послематчевых пенальти.
В последующие годы «Спартак» не раз подтверждал свои чемпионские полномочия, в период с 1992 по 2002 завоевав 9 из 11 титулов. В 1995 чемпионом стал «Спартак – Алания» (Владикавказ), а в 2002 – «Локомотив» (Москва), в «золотом матче» переигравший ЦСКА.
Список обладателей Кубка России более разнообразен, но в нем представлены в основном московские клубы. Помимо «Торпедо», в разные годы Кубок выигрывали: «Локомотив» (четырежды), «Спартак» (дважды), «Динамо» и ЦСКА. Лишь однажды – в 1999 – немосковскому клубу, а именно «Зениту» (С.-Петербург), удалось завоевать почетный трофей.
Весной 2003 чемпион страны и обладатель Кубка России впервые разыграли в матче между собой Суперкубок. Его обладателем стал «Локомотив» (Москва).
Максимум, чего удалось добиться на сегодня российским клубам в еврокубковых соревнованиях, – дойти до полуфинала (по два раза это сумели сделать «Спартак» и «Локомотив»).
Неудачным оказалось минувшее десятилетие и для сборной России. Невыразительная игра на первенстве Мира-94 и Евро-96. Чемпионат Мира-98 и Чемпионат Европы-2000, как и два последних олимпийских турнира по футболу, прошли и вовсе без нашего участия. В финальную часть мирового первенства 2002 российская сборная попала, но выступила слабо и выбыла из борьбы уже на групповой стадии.
Многие лидеры российского футбола 90-х начинали свою спортивную карьеру еще в советское время: И.Цымбаларь, С.Черчесов, И.Чугайнов, И.Добровольский и др. Вместе с тем, минувшее десятилетие открыло немало новых имен: А.Тихонов, И.Титов, А.Смертин, А.Панов, С.Семак, Д.Лоськов, Р.Гусев, М.Измайлов, Д.Сычев и др. Примета нового футбольного времени: немало россиян выступают сейчас за зарубежные команды. А в наших клубах появляется все больше легионеров, в том числе и ведущих игроков некоторых национальных сборных – таких, как чех И.Ярошек.
В последние годы предпринимаются попытки возродить массовый детский футбол, проводятся соревнования школьных и дворовых команд.